לאחר תקופה ממושכת של התפוררות השלטון המרכזי ואנרכיה, מצליחים העלווים (המתייחסים לעלי, חתנו של מוחמד) להתבסס בשלטון. מולאי אל-רשיד (1672-1660), מייסד השושלת השולטת במרוקו עד עצם היום הזה, משתלט על פאס ובין התומכים בו היו גם יהודים. על יחסו ליהודים יש גרסות שונות, ונראה שידע תמורות וסבל ממצבי רוח משתנים כלפי היהודים.